发布日期：2024-11-06 09:04 点击次数：168
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分析基因组数据时，豪迈需要展望基因的RNA选拔性剪切花样，即内含子和外显子的位置和数目。展望是基于RNA剪接的保守性序列“GU－AG”端正，即内含子5’端序列一般是GU，而3’端一般是AG，诚然它们近邻的序列亦然有一定例律的，但不是很保守。字据这一特色并纠合ORF, Blast等数据就可以对未知基因的锻真金不怕火mRNA序列进行展望。
底下保举几个比拟专科的RNA剪切展望网站：
Augustus （功能很是庞大，展望比拟准确，并莫得物种特异性，好坏保举）
https://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/submission.php
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2. SplicePort （功能也很全面，保举）
https://spliceport.cbcb.umd.edu/
3. GeneSplicer （只针对以下几个物种：Plasmodium falciparum (malaria), Arabidopsis thaliana, human, Drosophila, and rice）
https://www.cbcb.umd.edu/software/GeneSplicer/gene_spl.shtml
4. NetGene2 （只针对：Human, C. elegans, A. thaliana）
https://services.healthtech.dtu.dk/services/NetGene2-2.42/
5. MaxEntScan （只针对 Human）
http://hollywood.mit.edu/burgelab/maxent/Xmaxentscan_scoreseq.html
6. SPCards
周三050 欧洲杯 荷兰VS英格兰 2024-07-11 03:00
1. 浦项铁人俱乐部成立于1973年，球队历史曾获得5次韩K联赛冠军，4次韩国杯冠军，2次韩国联赛杯冠军，1次亚冠联赛冠军，以及在96/97/和97/98连续获得亚冠前身亚洲俱乐部锦标赛冠军等诸多赛事荣誉。
http://www.genemed.tech/spcards/home
该究诘全球发布了迄今最全面的东谈主类剪切突变数据库及剪切变异分析平台。究诘将18款剪接变异展望软件集成到SPCards数据库并评估不同软件的性能。效能发现剪切变异软件在识别剪切供体区域和剪切受体区域的剪接变异透深刻不同的性能。在剪切供体区间Kipoisplice，物联网app开发dbscSNV ADA，Spliceogen和SPiCE 的展望性能最佳，而在剪切受体区间dbscSNV ADA，SPiCE，dbscSNV RF和regsnp透露更好的展望性能，这指示在进行剪接变异展望时应字据不同的区域作念一定的权重性选拔。
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7. RNA splicer
https://rddc.tsinghua-gd.org/ai/rna-splicer
以上只针对某某物种的不代表其它物种不因循，仅仅效能可能不很准确，关于并吞基因，可以参考纠合以上不同的奇迹器给出的效能。
但愿以上网站对需要的一又友有所匡助做物联网软件多少钱，如若有什么问题随机保举其他用具，接待留言一样。
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